湖北省社会科学院成立之初,先后与之有隶属关系的单位有:1979年6月省委发文湖北省哲学社会科学联合会与湖北省社会科学院合署办公,1984年4月正式分开办公。1980年1月成立的鄂豫边区(新四军第五师)革命斗争史编辑室,日常工作由湖北省社会科学院代管,1985年其日常工作归口省委办公厅管理。1980年9月省政府批文成立湖北省地方志编纂委员会,其日常工作由湖北省社会科学院代管,至1984年10月归口为湖北省委宣传部领导其日常工作。
在研究机构方面,1979年,成立马列主义、毛泽东思想研究室、哲学研究所、经济研究所,历史研究所和情报资料室、《江汉论坛》编辑部、1982年成立文学研究所和政治学所(由马列主义、毛泽东思想研究室改)。1983年成立《社会科学动态》编辑部。1984年成立社会学研究所、农村经济研究所、楚史研究所、情报研究所。1986年成立长江流域经济所。1989年成立法学所。1997年成立政法所(政治学所与法学所合并)、邓小平理论研究中心。1989年成立图情中心情报所与图书馆合署)。